Ak v prvom kole žiak neuspel ani na jednej strednej škole, má možnosť si podať ďalšiu prihlášku do druhého kola. Rovnako to môže urobiť, ak bol prijatý len na jednu z dvoch vybraných stredných škôl.
- Rodič si vyzdvihne v základnej škole ďalšiu prihlášku a základná školu ju musí potvrdiť.
- Rodič môže proti neprijatiu svojho dieťaťa podať aj odvolanie. V rozhodnutí o neprijatí na štúdium, ktoré je vydané riaditeľom školy, je uvedené v poučení, kam má a do koľkých dní podať uchádzač odvolanie. Odvolanie sa zvyčajne podáva riaditeľovi strednej školy do 15 dní odo dňa doručenia. Riaditeľ strednej školy na základe posúdenia odvolania môže rozhodnutie zmeniť alebo odstúpi odvolanie odvolaciemu orgánu t.j. zriaďovateľovi.
- Keďže druhé kolo vypisujú riaditelia len tých škôl, ktoré v prvom kole nenaplnili triedy na plánovaný počet žiakov, na výber je nižší počet škôl.
- Priebežne aktualizované informácie o voľných miestach a konaní 2. kola po 1. kole prijímacích skúšok sú priebežne zverejňované na webstránkach školských výpočtových stredísk:
www.svsba.sk - pre školy Bratislavského kraja,
www.svspn.sk - pre školy Trnavského a Nitrianského kraja,
www.svsbb.sk - pre školy Banskobystrického kraja,
www.svslm.sk - pre školy Žilinského a Trenčianského kraja,
www.svsmi.sk - pre školy Košického a Prešovského kraja.
- Pri druhom kole by mal rodič zvážiť aj príčiny neúspechu svojho dieťaťa v prvom kole. Môže sa za tým skrývať doposiaľ neodhalené postihnutie či porucha, nadmerná tréma, neobjektívne zhodnotenie schopností dieťaťa alebo aj vyjadrenie nesúhlasu dieťaťa s výberom školy. Týmto faktorom by mal prispôsobiť aj výber školy v druhom kole.
- Vo výnimočných prípadoch, ak sa žiak nedostane na strednú školu ani v druhom kole, rodič školopovinného dieťaťa musí individuálne osloviť riaditeľov škôl so žiadosťou o prijatie.